Phyo Phyo Kyaw Zin
The journey of a cheminformatics scientist — tutorials on RDKit, molecular descriptors, machine learning, and drug discovery.
-
RDKit_2D Descriptors in Python – Part 4
This is part-4 from the five-part series tutorial of the blog post, Computing Molecular Descriptors – Intro, in the context of drug discovery. The…
-
ECFP6 Fingerprints in Python – Part 3
This is part-3 from the five-part series tutorial of the blog post, Computing Molecular Descriptors – Intro, in the context of drug discovery.…
-
MACCS Fingerprints in Python – Part 2
This is from the five-part series tutorial of the previous blog post, Computing Molecular Descriptors – Intro in the context of drug…
-
Computing Molecular Descriptors – Part 1
I will write a five-part series tutorial on implementing the python code to compute different sets of 2D molecular descriptors & fingerprints…
-
PCA Visualized with 3D Scatter Plots
Today’s tutorial is on applying Principal Component Analysis (PCA, a popular feature extraction technique) on your chemical datasets and visualizing them in…
-
ပါရဂူ (PhD) ခရီးစဉ်အတွက်သိကောင်းစရာများ
မြောက်ကာရိုလိုင်းနားပြည်နယ်တက္ကသိုလ် (ဓာတုဗေဒဌာနမှ) Cheminformatics ၌ ပါရဂူဘွဲ့ကိုမကြာမီက ကျွန်ုပ်ရရှိခဲ့သည်။ ကျွန်ုပ်သည်ပါရဂူဘွဲ့အတွက် သုံးနှစ်ခွဲလုပ်ကိုင်ခဲ့သည်။ ၂၀၁၆ ခုနှစ် သြဂုတ်လတွင် စတင်ခဲ့ပြီး မတ်လ ၂၄ ရက် ၂၀၂၀ တွင်စာမေးပွဲဖြေဆိုခဲ့သည်။ ထိုအချိန်အတောအတွင်း ဆောင်းပါးငါးခု (ဉီးစီးရေးသူအဖြစ်သုံးခု) ကိုထုတ်ဝေခဲ့သည်။ နောက်ဆောင်းပါးတစ်ပုဒ်မှာ…
-
11 Tips for a Great PhD Journey
I recently finished my PhD in Cheminformatics (from the Department of Chemistry) at North Carolina State University. I worked on my PhD…
-
How to Generate Chemical Space Visualizations with R & Gephi
Today, I want to write a tutorial on how to generate chemical space visualizations using a combination of R and Gephi. I…
-
In Loving Memories of Grandma.
MONDAY, OCTOBER 3, 2016 It has been a year since my grandma passed away. Losing her was one of the hardest things…